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La clasificación cientÃfica se refiere a la disciplina por la cual los biólogos agrupan y categorizan a los organismos (sean especies extintas o vivas) y a sus diferentes conjuntos (taxones).
La clasificación cientÃfica es una de las tareas de la biologÃa sistemática, y, más en particular, de la taxonomÃa biológica, que no sólo admite una jerarquización de caracterÃsticas y funciones (taxonomÃa), sino que también permite establecer un esquema de parentescos, similitudes y relaciones (sistemática) entre los diferentes organismos.
La utilidad principal de la clasificación es que en un nivel cientÃfico haya un consenso general y casi universal para establecer un orden esquemático sobre la enorme diversidad de los organismos.
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La clasificación moderna tiene sus raÃces en el sistema de Carlos Linneo (1753), que propuso la clasificación jerárquica de las especies según sus caracterÃsticas fÃsicas compartidas y normalizó su denominación. Pero también Linneo propuso la fórmula binominal, consistente en el uso de dos palabras para asignar un nombre único para cada especie: la primera es el nombre del género y la segunda es el epÃteto especÃfico; de esta forma, la combinación de ambas designa a la especie como si ésta tuviera "nombre y apellido".
Los taxones (grupos de la clasificación) están sujetos a una permanente revisión para mejorar la consistencia con el principio de la descendencia común, que desde Charles Darwin es la base del agrupamiento. La sistemática molecular, que utiliza análisis de ADN genómico, ha conducido a muchas modificaciones recientes y lo seguirá haciendo.
Un ejemplo de la renovación de la clasificación lo tenemos en el nivel más básico. Robert Whittaker venÃa reconociendo la existencia de cinco reinos, uno procariótico (Monera), y cuatro eucarióticos (Protista, Fungi, Animalia y Plantae). Ahora se distinguen dos dominios, Prokaryota, estructurado en dos reinos, Bacteria y Archaea, y Eukarya, dividido éste a su vez en los cuatro reinos arriba enumerados.
Filogenéticamente hablando, cabe aclarar que el primero en separarse del árbol evolutivo fue el reino Bacteria, quedando más cercanos filogenéticamente Archaea con Eukarya
